Elément de réponse : Article 129 du code des droits d'enregistrement

  L'acquisition par un ou plusieurs associés, autrement que par voie d'apport en société, d'immeubles situés en Belgique provenant d'une société en nom collectif ou en commandite simple, d'une société privée à responsabilité limitée ou d'une société agricole donne lieu, de quelque manière qu'elle s'opère, au droit établi pour les ventes.

En cas de remise des biens sociaux, par le liquidateur de la société en liquidation à tous les associés, l'alinéa qui précède s'applique à l'attribution ultérieure des biens à un ou plusieurs associés.
L'alinéa 1er n'est pas applicable en ce qui concerne :
1° les immeubles apportés à la société, lorsqu'ils sont acquis par la personne qui a effectué l'apport;
2° les immeubles acquis par la société avec paiement du droit d'enregistrement fixé pour les ventes, lorsqu'il est établi que l'associé qui devient propriétaire de ces immeubles faisait partie de la société au jour de l'acquisition par celle-ci.

Selon moi, si l'acquisition par les associés se fait dans la même proportion que leur nombre de parts (et qu'ils étaient déjà associés lors de l'acquisition de l'immeuble avec paiement des droits d'enregistrement dus pour les ventes au taux plein), il n'y a pas de droits d'enregistrement (droit fixe), sinon droit de partage de 1 %.

Pour l'imposition des boni de liquidation, j'attends d'autres commentaires