Si vous obtez pour une cohabitation de fait, vous devrez remplir une déclaration à l'impôt séparément et donc, seuls vos revenus et charges seront à considérer dans la susdite déclaration.

Pour la cohabitation légale, une seule déclaration sera à remplir (colonne de gauche pour votre ami et colonne de droite pour vous).
Dans ce cas, l'imposition sera différente pour certains aspects seulement.
Par exemple, les revenus immobiliers (cadre III) seront répartis de manière égale entre vous et votre ami. Plus en détail, il s'agira du revenu cadastral non indexé de l'habitation.
C'est le genre de différences auxquelles vous devez vous attendre.

Pour les cotisation de la voiture de société, il me semble qu'il s'agit d'un ATN repris sur votre fiche de rémunération (je peux me tromper). Il ne s'agit donc pas de calculer des frais liés au trajet domicile-lieu de travail.

Ces informations sont incomplètes mais constituent un début